Hlavným rozdielom je rozdiel v aktívnom materiáli. Aktívny materiál sekundárnej batérie je reverzibilný, zatiaľ čo aktívny materiál primárnej batérie nie je reverzibilný. Samovybíjanie primárnej batérie je oveľa menšie ako sekundárnej batérie, ale vnútorný odpor je oveľa väčší ako u sekundárnej batérie, takže nosnosť je nižšia.
Navyše, hmotnostne špecifická kapacita a objemová špecifická kapacita primárnej batérie sú väčšie ako u bežných dobíjacích batérií.
