Skladovanie kryogénneho kvapalného vodíka znamená ochladenie vodíka na -253 stupeň, jeho skvapalnenie a následné naplnenie do kryogénnej skladovacej nádrže. Hustota kvapalného vodíka je 70,6 kg/m3 a jeho hmotnostná hustota a objemová hmotnosť sú tiež oveľa vyššie ako pri vysokotlakovom skladovaní plynného vodíka.
Je to mimoriadne ideálny spôsob skladovania vodíka. Proces skvapalňovania vodíka však vyžaduje veľa energie. Podľa údajov si skvapalnenie 1 kg vodíka vyžaduje 10-20kWh elektrickej energie. Okrem toho musí zásobník na skladovanie kvapalného vodíka používať špeciálny zásobník s ultranízkou teplotou.
Akumulačná náplň a nedokonalá tepelná izolácia môžu ľahko viesť k strate odparovania vodíka. Preto sú náklady na skladovanie kvapalného vodíka vysoké. Tieto faktory obmedzujú použitie kvapalného vodíka.