Vzťahuje sa na odpor prúdu pretekajúceho batériou, keď je batéria v prevádzke. Pozostáva z ohmického vnútorného odporu a polarizačného vnútorného odporu.
Veľký vnútorný odpor batérie spôsobí zníženie pracovného napätia vybíjania batérie a skrátenie doby vybíjania. Vnútorný odpor ovplyvňujú najmä faktory ako materiál batérie, výrobný proces a štruktúra batérie. Je to dôležitý parameter na meranie výkonu batérie.
Poznámka: Vo všeobecnosti sa ako štandard používa vnútorný odpor v stave nabitia. Vnútorný odpor batérie je potrebné merať špeciálnym meračom vnútorného odporu, nie ohmovým prevodom multimetra.